Operaens lille scene hedder Takkelloftet og har separat indgang på bagsiden af Operaen. Rummet – blandt fagfolk kaldet en black box – er et multifunktionelt rum, som kan indrettes fleksibelt, så der er plads til eksperimenter og hybrider mellem de forskellige kunstarter. Medvirkende til scenens fleksible ramme er 13 flytbare tårne, der både kan benyttes som scenografisk element og som publikumstribune. Salen kan rumme op til i alt 180 teatergæster. Det store maleri, som kan ses i Takkelloftets foyer, er malet af kunstneren Tal R.